Ezerā ir 120 mg sāļu litrā, tātad ezers pieder pie slikti mineralizētiem ūdeņiem, hlorīdu un sulfātu-7%, sārmu metālu-9% un 1200 tonnas dažādu vielu ūdenī no Baikāla apkārtnes. Ūdens ķīmija ir viendabīga, jo notiek regulāra ūdens apmaiņas process. Ūdens blīvums ir ir tikpat kā destilētam ūdenim. Baikāla ezerā ir daudz neparastu radījumu, no kurām ir neparastas baktērijas, un tāpēc ūdenī ir daudz neparastu baktēriju. Baikāla organismi piemērojušies dzīvei ļoti šaurā temperatūras diapazonā.
Baikāla dažos ūdeņos ir piesārņojums, tāpēc ka ir uzbūvēts pie Baikāla hidroelektro stacija (vai kā to sauca), pie ezera ir zinātniskie pētījumi, kur atklājās ka Baikālā ir bezdibenis (ir vairāki informācijas avoti no interneta!)-tas ir savienots ar zemes kodolu. Kāpēc vasarā un pavasarī nav nokrišņu? Tāpēc ka no Baikāla aukstajām virsmām maz iztvaiko ūdeni.
http://www.youtube.com/watch?feature=player_detailpage&v=zlblkllHdo8